بل على العكس، أبدى الرفاعي تأييده للشعارات التى رفعها السلفيون و"الإخوان" خلال مليونية "الإرادة الشعبية" والتي واجهوا بسببها انتقادات من التيار الليبرالي، وأشار خاصة إلى تأييده مطالبتهم بأن تكون مصر إسلامية كما رددوا في هتافاتهم خلال المظاهرة الحاشدة, وقال: نحن نهتف معهم ونقول "إسلامية .. إسلامية"،، وأعلن أن يد "الرفاعية" ممدودة للجميع بمن فيهم "السلفية" و"الإخوان".